[Jean le Chauve]

1) $config['assume_mod_rewrite'] = true;
Ne pas oublier l'htaccess.
$config['internal_pretty_urls'] = false;

2)http://googlewebmastercentral.blogspot.c...nical.html
Placer ceci dans les métadonnées globales (paramètres globaux) :

Code :

{if isset($canonical)}<link rel="canonical" href="{$canonical}" />{elseif isset($content_obj)}<link rel="canonical" href="{$content_obj->GetURL()}" />{/if}

3) C'est la première chose à faire si l'on veut être indexé rapidement au lieu de réécrire les liens en dur.
Cmsms t'a mâché le travail, il y a un module tout fait : SiteMapMadeSimple.
En passant, je remarque que tu n'as pas suivi mes conseils pour le breadcrumbs et les pages préc. et suiv. (si tu n'as pas envie qu'on les voie, tu n'as qu'à les cacher par css en laissant les bots les suivre).