[Jean le Chauve]

mais lorsque je clique sur le dossier "Upload", je ne peux y accéder

Je suppose donc que tu es à la racine.
Il n'y a pas de dossier "Upload", mais bien "uploads".
Quel est le chemin désigné par le lien ? Le mien est m1_newdir=uploads et fonctionne parfaitement.

Code :

[== Indéfini ==]
http://test1_12/admin/moduleinterface.php?mact=FileManager,m1_,changedir,0&_sx_=4e681dabbf12d692&m1_newdir=uploads&m1_path=%2F&m1_sortby=nameasc

Je n'arrive pas à reproduire ton problème.