[Jean le Chauve]

Là, ça va être plus difficile : généralement, lorsqu'on a une css par navigateur, c'est que le code css n'est pas hacké, et que le choix de la feuille doit être indiqué dans le code html par des commentaires conditionnels (surtout qu'il n'y en a qu'une appelée par le navigateur : la sienne).
Donc, à mon humble avis, 2 css distinctes à placer dans un répertoire css et la générale à insérer par l'administration et à attacher au gabarit.
Et, malgré les réticences de mes camarades envers IE6, c'est un navigateur encore très utilisé et il faut donc le prendre en compte.
Ton code semble donc approprié :
<!--[if IE 6]><link rel="stylesheet" href="style.ie6.css" type="text/css" media="screen" /><![endif]-->
<!--[if IE 7]><link rel="stylesheet" href="style.ie7.css" type="text/css" media="screen" /><![endif]-->